李聚奎在解放战争中,变我军后勤从取之于敌到建立稳固后方,保障了大兵团作战;抗美援朝期间,建立了打不烂、炸不垮,连美军司令都佩服得五体投地的“钢铁运输线”,还将“炒面”成功运用到志愿军伙食中,为战争胜利提供了强有力的后勤保障。
鉴于李聚奎在军队后勤战线上的丰富经验和显著成绩,1952年8月22日,毛主席签署命令,任命他为后勤学院院长兼东北军区后勤部部长。
毛主席对培养后勤人才的重视,时刻鞭策着履新的李聚奎。《朝鲜战争停战协定》虽已签订,但只是停战,战火尚未完全熄灭,这使他忧心忡忡,如芒在背。刚上任不到两天,他就向彭德怀副主席写信,请辞兼任的东北军区后勤部部长一职。

1964年1月,北京中南海怀仁堂,在军委召开的全军后勤工作会议上,李聚奎得到了毛主席的亲切接见。
1953年4月6日,军委又让他兼任总后勤部训练部部长,他同样于1954年底辞去这一职务。3年里,他集中精力抓学院建设、培养优秀后勤人才,为之耗尽心神。