医院科研能力较强、研究水平较高。目前，医院承担了国家、军队和福建省科研项目370余项，其中重大项目10余项。多个研究项目有望取得重大突破。“十五”以来，医院获国家、军队科技进步、医疗成果奖和福建省科学技术奖209项，其中国家科技进步二等奖3项，军队科技进步一等奖3项，军队医疗成果一等奖1项，福建省科学技术一等奖5项、二等奖31项。在国内外期刊上发表学术论文7000余篇，出版专著80余部。
医院重视科学化管理工作，1998年以来，医院建立了以信息技术开发和推广应用为主要内容的国家金卫工程“军字一号”，有67台服务器、2500多个计算机工作站联网并正常运行，使全院日常医疗、护理、教学、办公实现数字化。各类信息系统，如医院信息系统（HIS）、医学图像传输与存贮系统（PACS）、临床检验信息系统（LIS）、麻醉信息系统、心电监护系统、心电图信息系统、办公自动化系统（OA）均实现无缝联接，初步建成数字化医院。
医院重视全面建设，坚持正确的办院方针，树立“以病人为中心”的服务理念，坚持为部队服务方向，将“团结、奋进、德高、技精”作为院训，以质量效率为基础、科技为先导，大胆改革、开拓创新，严格执行医疗护理等各项规章制度，不断完善质量管理体系，极大地促进了医疗护理服务质量的提高。医院注重医德医风建设，开展了让病人“方便、放心、满意”等活动，并全面实施整体护理与健康教育工作，不断拓宽服务项目、深化服务内涵，密切了医患、护患关系，涌现了“军中白求恩”温端生、“医护天使”孟卫平等一大批享誉军内外的先进典型，他们以精湛的技术、优良的服务，赢了军内外患者的广泛赞誉。
