建校以来，已为军队培养了8万余名医学专业人才，其中研究生9000余人。不少毕业生已成为国内外知名的专家学者和我军各级卫生机构的领导，有1 位全国政协副主席，2位中将，34位少将，147位三级以上教授，还涌现出了被国家和军队授予“富于理想、勇于献身的优秀大学生(张华)”、“华山抢险战斗集体”和“模范学员大队”等荣誉称号的一批先进典型，作为全国教育界和军队先进院校先进典型，曾经“四进中南海，九进大会堂”。教学改革成绩显著，2001年获得国家级教学成果特等奖，国内仅有清华大学、北京大学与第四军医大学三所高校获此殊荣，2009年，学校再获国家级教学成果一等奖。目前在校学员5000余名，其中研究生2000余名。
学校高度重视科学研究和对外学术交流。近年来，在基础医学、临床医学、军事医学、药学、生物医学工程等方面，取得了一大批研究成果。“十一五”以来，共获“973”首席科学家项目4项，省部级以上科研项目1800余项， 2008年以来，获批的各类科研经费总额超过12.25亿元。近五年，在SCI收录杂志发表论文数量稳居全国医科院校前茅，部分论文发表在《Lancet》等国际知名的高水平学术杂志。成功研发高原单兵增氧仪、非接触式生命探测仪、高性能战机飞行员生理心理检测系统等一大批新型卫生装备。特别是近四年连续获得5项国家科技进步一等奖，在颌面战创伤救治、军人心理选拔、心脑血管保护、胃癌治疗、疼痛研究等方面取得重要突破，为提升我军卫生工作和战伤救治水平作出了新贡献。1980年以来，共获得各类科技成果奖1269项，其中国家自然科学奖1项、国家技术发明奖7项、国家科技进步奖53项（其中一等奖5项）、军队科技进步一等奖29项、军队医疗成果一等奖16项、省科技进步一等奖65项。成功实施了世界首例心、肝、肾联合移植手术，国内首例、世界第二例“换脸术”，世界首例“坑面女”、罕见“缺面男”颌面修复再造术。国内首例心、肝、肾联合移植手术等高难度手术，在国内外产生广泛影响；新增部队体系保障任务1.8万余人，与22所基层部队医院建立了帮带关系，共派出医疗队194批821人次，多次被评为“全军为部队服务先进单位”。1978年以来，先后共派出4500多人次到64个国家和地区的教学、医疗或研究机构留学和学术交流；接待92个国家和地区的近万名专家学者来校访问，其中18位是生理学或医学诺贝尔奖获得者。目前学校已与美、英、日、法、德、澳等国家的近30多个学术机构建立了稳定的学术交流渠道和合作关系。
