在出席了2009年9月一次关于阿富汗战争的会议后，盖茨称他打算辞职，因为他“对奥巴马政府上下官员对战争的不确定性和不可预测性的缺乏认识深感不安”。
美国国家安全委员会发言人海登(Caitlin Hayden)随后在一份声明中为奥巴马的阿富汗战争策略做出辩护。她说：“众所周知，总统先生一直致力于完成破坏、摧毁和战胜‘基地’组织的任务，同时也致力于确保我们有一个明确的计划以结束这场战争。”
海登同时还回击盖茨对副总统拜登的评价，盖茨曾在书中称拜登“过去40年在几乎所有重要的外交政策和国家安全议题中犯错”。海登说：“总统先生不同意盖茨部长的评价……拜登先生位列他任期内最重要的政治家的行列，并且帮助美国在全球范围内提升了领导力。”
此外，盖茨对奥巴马批准围剿在巴基斯坦的本·拉登的指令作出肯定，称这是他所见到的，白宫所作出的最有勇气的决定之一。
据悉，盖茨此前曾为美国前总统小布什效力，并曾在奥巴马上任后留任五角大楼长达两年。
